1 引言：论文为什么总卡在正文前
文献找了几十篇，图表也画好了，真正坐到正文前却不知道从哪一句落笔。这是 SCI 写作中最常见的停滞点：材料持续增加，研究主线反而越来越模糊。
逐段向 AI 提问可以暂时补满页面，但一旦研究问题、证据与结论没有对齐，返工成本会成倍增加。问题不在 AI 不够强，而在 AI 进入写作流程的位置不对。
把 AI 放进写作流程的正确方式，是先让它整理材料、检查逻辑、显露缺口，再按研究者已经确认的证据起草。本指南将这一过程拆成五步：建立文献地图、搭建逻辑骨架、按证据分节起草、三遍润色、投稿前审查与选刊。每一步配一个专用工具，并给出可直接复用的提示词。
表1 五步工作流全景
步骤 | 核心任务 | 关键产出 |
|---|---|---|
第一步 建立文献地图 | 明确研究问题，检索并组织文献 | 文献矩阵与研究问题表述 |
第二步 搭建逻辑骨架 | 规划章节任务与证据支撑关系 | IMRaD 大纲与证据论点映射 |
第三步 按证据分节起草 | 基于已核验材料分节成文 | 结构完整的初稿 |
第四步 三遍润色 | 论证、证据、语言三轮检查 | 可提交的修改稿 |
第五步 投稿前审查与选刊 | 全稿审查与期刊匹配 | 定稿与目标期刊清单 |
2 第一步：立住研究问题，建立文献地图
2.1 先写一句话研究问题
选题刚起步时，先别急着攒 PDF。研究问题应能用一句话说清三件事：研究对象是什么、在什么条件下、要回答什么样的关系或机制。写不清楚这一句，后续检索与大纲都会失去锚点。
2.2 检索策略与 AI 能力边界
检索应围绕核心概念、研究方法与应用场景分别进行，而不是一次泛搜。AI 适合承担关键词扩展、结果去重与文献矩阵构建；标题、摘要和数据库元数据只用于初步筛选，涉及方法细节或数值的结论必须回到全文确认。
2.3 文献地图工具
nature-academic-search 是面向学术检索的辅助工具，可按学科把检索路由到 PubMed、CrossRef、arXiv、Semantic Scholar 等来源，并处理去重、引用核验与 BibTeX/RIS 格式转换。需要说明的是，中文文献仍须在知网、万方等渠道另行检索，该工具不覆盖中文数据库。
工具仓库地址：https://github.com/wp-a/nature-academic-search
2.4 判断标准
搜索结果多不等于综述完整。正确做法是先记录每篇文献支持什么问题，再决定是否保留；否则文献矩阵很快会变成另一份收藏夹。这一条同样适用于人工检索。
3 第二步：搭建论文逻辑骨架
3.1 大纲的本质
有了证据表，先别急着让 AI 写全文。大纲真正要解决的是三件事：每一节回答什么问题、哪条证据支撑哪一句话、结果与讨论之间有没有越界。
一个好大纲应当暴露缺口，而不是用漂亮的小标题把缺口盖住。大纲阶段发现的材料不足，远比成稿阶段返工代价小。
3.2 大纲工具与适用边界
academic-paper-strategist 用于目标平台分析、文献与缺口梳理、详细大纲生成和评审式检查。项目作者说明其经验主要来自哲学及跨学科论文；若用于实验医学、工程或临床研究，报告规范与方法要求仍需另行补入。
工具仓库地址：https://github.com/lishix520/academic-paper-skills
3.3 IMRaD 大纲四要素
生成大纲时，每一小节都应写明四项内容：本节目的、必须使用的证据、不能越过的推断边界、与下一节的连接。材料不足以支撑某个常见章节时，应标记为待补证据，而不是用常识填空。
4 第三步：按证据分节起草
4.1 为什么分节推进
初稿阶段建议按 section 推进。给 AI 的输入越具体，输出越容易检查。一次生成全文，往往只是把五处小问题变成一篇难以追踪的大问题。
4.2 各章节的输入要求
不同章节对输入材料的要求不同。Methods 需要真实流程与参数，Results 需要表格与统计量，Discussion 需要已经核验的文献与清晰的推断边界。材料缺失时，用【待作者补充：字段】占位，禁止推测数值或操作。
起草时先列出事实清单并标注来源位置，再写初稿。Methods 按实际发生顺序写，保留软件版本、阈值与排除规则；Results 依次报告方向、效应量、区间与显著性，不解释原因。
4.3 证据纪律
scientific-agent-skills 要求每条事实来自用户材料、已核验检索或无具体数字的领域常识，并严格区分已得到的结果与计划中的结果。没有证据支持的主张会被检索、改写或删除，不靠占位符把段落凑完整。
工具仓库地址：https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
5 第四步：三遍润色法
5.1 三遍各有目标
第一遍只求把论证写全；第二遍检查图表、方法细节与段落证据；第三遍统一术语、时态与语言。三遍各有目标，远比边写第一句边追求终稿感轻松。AI 在第三遍最顺手，也能在前两遍指出重复与结构断点。
5.2 保守润色原则
paper-polish 针对已有文本做语法、流畅度、证据强度与 AI 腔校准，默认保守修改。纯语言问题可以直接修；可能改变科学含义的改动必须单独标出。不能把相关性润色成因果关系，也不能替作者补数字和机制。
工具仓库地址：https://github.com/Lylll9436/Paper-Polish-Workflow-skill
5.3 润色检查清单
润色完成后依次确认：数据、引用、限定词与结论强度是否保持不变；长句、重复表达、术语不一致与中式英语是否已处理；夸张或模板化措辞是否删除；涉及科学含义的改动是否已单独列出并经作者确认。
6 第五步：投稿前审查与选刊
6.1 终稿审查
终稿前三到五天，给论文做一次从宏观逻辑到图表质量的完整检查。先修会阻塞投稿的问题，再处理措辞与格式，避免在低优先级问题上消耗时间。
6.2 选刊纪律
选刊时可以让 AI 根据题名、摘要、关键词与方法列出候选，但期刊范围、文章类型、最新影响因子、审稿周期与费用，都必须回到期刊官网或权威数据库核验。AI 的作用是缩小候选范围，不是替你决定投哪里。
6.3 候选期刊清单要素
venue-templates 的职责，是在候选期刊已经形成后，调用目标期刊或会议的格式模板与提交要求，检查稿件结构、版式和附件是否匹配。候选池可通过出版社官方 Journal Finder 生成，再由 AI 逐本核对 Aims & Scope。
工具仓库地址：https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills（venue-templates 位于该仓库）
每本候选期刊应列出：匹配的 Aims & Scope 原文证据及官网链接、可投稿文章类型、当前 JCR/CAS 信息及年份、OA 模式与 APC、公开可核验的审稿周期、潜在风险。凡无法从官方或明确来源确认的信息，写未核实，不要估算录用率。
7 五步工作流的通用纪律与边界
7.1 任务拆解的价值
论文难写，常常因为每一步都挤在同一个晚上：一边找文献，一边想框架，还顺手改语法。把任务拆开后，卡在哪里会变得很具体，也不必再等一个替你写完的模型。
7.2 证据纪律汇总
贯穿五步的是一条证据纪律：每条事实可溯源，区分已得结果与计划结果，材料不足时标记待补而不是编造。AI 是放大器，不是替代品。
表2 五步工具清单
步骤 | 工具 | 主要用途 | 仓库地址 |
|---|---|---|---|
第一步 文献地图 | nature-academic-search | 多库检索、去重、引用核验 | github.com/wp-a/nature-academic-search |
第二步 逻辑骨架 | academic-paper-strategist | 目标平台分析、大纲、评审检查 | github.com/lishix520/academic-paper-skills |
第三步 分节起草 | scientific-agent-skills | 基于证据的受控起草 | github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills |
第四步 润色 | paper-polish | 语言润色与 AI 腔校准 | github.com/Lylll9436/Paper-Polish-Workflow-skill |
第五步 选刊审查 | venue-templates | 稿件与期刊模板匹配 | github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills |
7.3 AI 不能做什么
AI 不能代写研究结论，不能编造数据与文献，不能替作者判断期刊匹配度，也不能把相关性解释成因果关系。五步流程的每一步，研究者都保留最终判断与核验责任。
8 结语
今天先把研究问题和证据表做实，明天再搭骨架。初稿允许粗糙，修改轮次各有目标。等五步逐渐固定成自己的工作流，AI 节省下来的，才是真正无效的来回折腾。
附录 提示词模板集
以下提示词整理自原文，使用时替换方括号中的字段即可。所有输出均需回到原文或原始材料核验后再采用。
附录A 文献地图提示词
使用 nature-academic-search 围绕以下研究问题建立文献地图。
研究问题：【填写】
时间范围：【填写】
必须覆盖的概念、方法与场景：【填写】
请分三轮检索，合并重复条目，并按直接回答问题、提供方法、提供背景分组。
当前只依据元数据与摘要筛选；需要全文才能确认的机制、参数和结果请标为待读，不要代写结论。
附录B IMRaD 大纲提示词
请只做论文规划，不写正文。我的研究问题是【问题】，研究设计是【实验/观察性/建模/其他】，核心材料包括【证据矩阵、方法说明、结果表】。目标期刊或学科惯例为【信息】。
请生成 IMRaD 大纲：每一小节写明本节目的、必须使用的证据、不能越过的推断边界、与下一节的连接。如果材料不足以支持某个常见章节，请标为待补证据，不要用常识填空。
附录C 分节起草提示词
请依据我提供的材料起草【Methods/Results】中的【小节名】。可用材料只有【粘贴方法记录、参数、表格或统计输出】。
先列出事实清单并标注来源位置，再写【目标字数】字初稿。Methods 按实际发生顺序写，保留软件版本、阈值和排除规则；Results 依次报告方向、效应量、区间和显著性，不解释原因。任何缺失信息用【待作者补充：字段】占位，禁止推测数值或操作。
附录D 润色提示词
使用 paper-polish 对下面的 Discussion 做轻度润色。保持原有数据、引用、限定词和结论强度不变。优先处理长句、重复表达、术语不一致和中式英语；删除夸张或模板化措辞。任何可能改变科学含义的改法，请保留原句并单独列出建议，不要直接替换。正文：【粘贴】
附录E 选刊提示词
根据论文标题、摘要、关键词和研究类型【粘贴】，先判断主学科与次学科，再给出 5 本候选期刊，分为冲刺 2 本、匹配 2 本、保底 1 本。每本期刊必须列出：匹配的 Aims & Scope 原文证据及官网链接、可投稿文章类型、当前 JCR/CAS 信息及年份、OA 模式与 APC、公开可核验的审稿周期、潜在风险。凡无法从官方或明确来源确认的信息写未核实，不要估算录用率。